No 1942. gada jūnija komandēja Ļeņingradas fronti, kas 1943. gada janvārī kopā ar Volhovas frontes karaspēku veica Ļeņingradas blokādes pārraušanu un 1944. gada janvāra un februāra kaujās ieņēma Ļeņingradas apgabalu.
1944. gada jūnijā uzvarēja Somijas armiju Viborgas aizstāvēšanas kaujā un okupēja Karēlijas austrumu daļu. 1944. gada septembrī/novembrī Ļeņingradas frontes karaspēks okupēja Igauniju un Vidzemi. 1945. gada 1. aprīļa Ļeņingradas frontes sastāvā iekļāva arī Sarkanās armijas daļas, kas cīnījās Kurzemes frontē, un līdz kapitulācijai 8. maijā Govorovs komandēja arī šīs kaujas operācijas.
Pēc kara komandēja Ļeņingradas kara apgabalu, pēc 1946. gada aprīļa ieņemdams dažādus citus augstus militāros amatus, tai skaitā PSRS kādu laiku bija PSRS pretgaisa aizsardzības spēku komandieris. Miris 1955. gadā.