PPRC1

PPRC1
Ідентифікатори
Символи	PPRC1, PRC, peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1, PPARG related coactivator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617462 MGI: 2385096 HomoloGene: 9006 GeneCards: PPRC1
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclear receptor coactivator activity • nucleic acid binding • GO:0001104 transcription coregulator activity • RNA binding • transcription factor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • mitochondrion organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23082	226169
Ensembl	ENSG00000148840	ENSMUSG00000055491
UniProt	Q5VV67	Q6NZN1
RefSeq (мРНК)	NM_001288727 NM_001288728 NM_015062	NM_001081214 NM_145504 NM_001346801
RefSeq (білок)	NP_001275656 NP_001275657 NP_055877	NP_001074683 NP_001333730
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.13 – 102.15 Mb	Хр. 19: 46.03 – 46.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PPRC1 (англ. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 664 амінокислот, а молекулярна маса — 177 544.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAARRGRRDG		VAPPPSGGPG		PDPGGGARGS		GWGSRSQAPY		GTLGAVSGGE
QVLLHEEAGD		SGFVSLSRLG		PSLRDKDLEM		EELMLQDETL		LGTMQSYMDA
SLISLIEDFG		SLGESRLSLE		DQNEVSLLTA		LTEILDNADS		ENLSPFDSIP
DSELLVSPRE		GSSLHKLLTL		SRTPPERDLI		TPVDPLGPST		GSSRGSGVEM
SLPDPSWDFS		PPSFLETSSP		KLPSWRPPRS		RPRWGQSPPP		QQRSDGEEEE
EVASFSGQIL		AGELDNCVSS		IPDFPMHLAC		PEEEDKATAA		EMAVPAAGDE
SISSLSELVR		AMHPYCLPNL		THLASLEDEL		QEQPDDLTLP		EGCVVLEIVG
QAATAGDDLE		IPVVVRQVSP		GPRPVLLDDS		LETSSALQLL		MPTLESETEA
AVPKVTLCSE		KEGLSLNSEE		KLDSACLLKP		REVVEPVVPK		EPQNPPANAA
PGSQRARKGR		KKKSKEQPAA		CVEGYARRLR		SSSRGQSTVG		TEVTSQVDNL
QKQPQEELQK		ESGPLQGKGK		PRAWARAWAA		ALENSSPKNL		ERSAGQSSPA
KEGPLDLYPK		LADTIQTNPI		PTHLSLVDSA		QASPMPVDSV		EADPTAVGPV
LAGPVPVDPG		LVDLASTSSE		LVEPLPAEPV		LINPVLADSA		AVDPAVVPIS
DNLPPVDAVP		SGPAPVDLAL		VDPVPNDLTP		VDPVLVKSRP		TDPRRGAVSS
ALGGSAPQLL		VESESLDPPK		TIIPEVKEVV		DSLKIESGTS		ATTHEARPRP
LSLSEYRRRR		QQRQAETEER		SPQPPTGKWP		SLPETPTGLA		DIPCLVIPPA
PAKKTALQRS		PETPLEICLV		PVGPSPASPS		PEPPVSKPVA		SSPTEQVPSQ
EMPLLARPSP		PVQSVSPAVP		TPPSMSAALP		FPAGGLGMPP		SLPPPPLQPP
SLPLSMGPVL		PDPFTHYAPL		PSWPCYPHVS		PSGYPCLPPP		PTVPLVSGTP
GAYAVPPTCS		VPWAPPPAPV		SPYSSTCTYG		PLGWGPGPQH		APFWSTVPPP
PLPPASIGRA		VPQPKMESRG		TPAGPPENVL		PLSMAPPLSL		GLPGHGAPQT
EPTKVEVKPV		PASPHPKHKV		SALVQSPQMK		ALACVSAEGV		TVEEPASERL
KPETQETRPR		EKPPLPATKA		VPTPRQSTVP		KLPAVHPARL		RKLSFLPTPR
TQGSEDVVQA		FISEIGIEAS		DLSSLLEQFE		KSEAKKECPP		PAPADSLAVG
NSGGVDIPQE		KRPLDRLQAP		ELANVAGLTP		PATPPHQLWK		PLAAVSLLAK
AKSPKSTAQE		GTLKPEGVTE		AKHPAAVRLQ		EGVHGPSRVH		VGSGDHDYCV
RSRTPPKKMP		ALVIPEVGSR		WNVKRHQDIT		IKPVLSLGPA		APPPPCIAAS
REPLDHRTSS		EQADPSAPCL		APSSLLSPEA		SPCRNDMNTR		TPPEPSAKQR
SMRCYRKACR		SASPSSQGWQ		GRRGRNSRSV		SSGSNRTSEA		SSSSSSSSSS
SRSRSRSLSP		PHKRWRRSSC		SSSGRSRRCS		SSSSSSSSSS		SSSSSSSSSR
SRSRSPSPRR		RSDRRRRYSS		YRSHDHYQRQ		RVLQKERAIE		ERRVVFIGKI
PGRMTRSELK		QRFSVFGEIE		ECTIHFRVQG		DNYGFVTYRY		AEEAFAAIES
GHKLRQADEQ		PFDLCFGGRR		QFCKRSYSDL		DSNREDFDPA		PVKSKFDSLD
FDTLLKQAQK		NLRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Andersson U., Scarpulla R.C. (2001). Pgc-1-related coactivator, a novel, serum-inducible coactivator of nuclear respiratory factor 1-dependent transcription in mammalian cells. Mol. Cell. Biol. 21: 3738—3749. PMID 11340167 DOI:10.1128/MCB.21.11.3738-3749.2001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vercauteren K., Pasko R.A., Gleyzer N., Marino V.M., Scarpulla R.C. (2006). PGC-1-related coactivator: immediate early expression and characterization of a CREB/NRF-1 binding domain associated with cytochrome c promoter occupancy and respiratory growth. Mol. Cell. Biol. 26: 7409—7419. PMID 16908542 DOI:10.1128/MCB.00585-06

Див. також

• Хромосома 10