SLC1A6

SLC1A6
Ідентифікатори
Символи	SLC1A6, EAAT4, solute carrier family 1 member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 600637 MGI: 1096331 HomoloGene: 21055 GeneCards: SLC1A6
Реагує на сполуку
ТВОА
Онтологія гена Молекулярна функція • L-aspartate transmembrane transporter activity • symporter activity • L-glutamate transmembrane transporter activity • amino acid transmembrane transporter activity • high-affinity glutamate transmembrane transporter activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • intermediate filament cytoskeleton • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • glutamatergic synapse • integral component of presynaptic membrane Біологічний процес • chemical synaptic transmission • regulation of membrane potential • ion transport • glutamate secretion • aspartate transmembrane transport • L-glutamate transmembrane transport • L-glutamate import across plasma membrane • amino acid transport • L-aspartate transmembrane transport • neurotransmitter uptake • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6511	20513
Ensembl	ENSG00000105143	ENSMUSG00000005357
UniProt	P48664	O35544
RefSeq (мРНК)	NM_001272087 NM_001272088 NM_005071 NM_001384669 NM_001384670 NM_001384671	NM_009200
RefSeq (білок)	NP_001259016 NP_001259017 NP_005062	NP_033226
Локус (UCSC)	Хр. 19: 14.95 – 15.02 Mb	Хр. 10: 78.62 – 78.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLC1A6 (англ. Solute carrier family 1 member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 61 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSHGNSLFL		RESGQRLGRV		GWLQRLQESL		QQRALRTRLR		LQTMTLEHVL
RFLRRNAFIL		LTVSAVVIGV		SLAFALRPYQ		LTYRQIKYFS		FPGELLMRML
QMLVLPLIVS		SLVTGMASLD		NKATGRMGMR		AAVYYMVTTI		IAVFIGILMV
TIIHPGKGSK		EGLHREGRIE		TIPTADAFMD		LIRNMFPPNL		VEACFKQFKT
QYSTRVVTRT		MVRTENGSEP		GASMPPPFSV		ENGTSFLENV		TRALGTLQEM
LSFEETVPVP		GSANGINALG		LVVFSVAFGL		VIGGMKHKGR		VLRDFFDSLN
EAIMRLVGII		IWYAPVGILF		LIAGKILEME		DMAVLGGQLG		MYTLTVIVGL
FLHAGIVLPL		IYFLVTHRNP		FPFIGGMLQA		LITAMGTSSS		SATLPITFRC
LEEGLGVDRR		ITRFVLPVGA		TVNMDGTALY		EALAAIFIAQ		VNNYELNLGQ
ITTISITATA		ASVGAAGIPQ		AGLVTMVIVL		TSVGLPTEDI		TLIIAVDWFL
DRLRTMTNVL		GDSIGAAVIE		HLSQRELELQ		EAELTLPSLG		KPYKSLMAQE
KGASRGRGGN		ESAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт амінокислот, симпортний транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, калію, іоном натрію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Fairman W.A., Vandenberg R.J., Arriza J.L., Kavanaugh M.P., Amara S.G. (1995). An excitatory amino-acid transporter with properties of a ligand-gated chloride channel. Nature. 375: 599—603. PMID 7791878 DOI:10.1038/375599a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19