Το Πανελλήνιο πρωτάθλημα 1933-34 διεξήχθη σε δύο ομίλους: Βόρειο με τέσσερις ομάδες της Ε.Π.Σ. Μακεδονίας και Νότιο με έξι ομάδες, τέσσερις από την ΕΠΣ Αθήνας και δύο από την ΕΠΣ Πειραιώς. Οι νικητές των δύο ομίλων αγωνίστηκαν σε διπλό τελικό. Η εθνική κατηγορία, στην οποία όσοι σύλλογοι μετείχαν δε λάβαιναν μέρος στα τοπικά πρωταθλήματα, καταργήθηκε[1]. Έτσι οι σύλλογοι αγωνίστηκαν πρώτα στο τοπικό πρωτάθλημα και στη συνέχεια στο πανελλήνιο. Ουσιαστικά η ρύθμιση αυτή έγινε για να ευνοηθεί ο Παναθηναϊκός, ο οποίος είχε υποβιβαστεί την προηγούμενη χρονιά 1932-33, αφού είχε αρνηθεί να δώσει αγώνες διαβάθμισης. Σημειωτέον, ότι, τόσο η Ε.Π.Σ.Α. όσο και ο ΠΑΟ, επέμεναν στην κατάργηση του θεσμού της Εθνικής Κατηγορίας, ο οποίος είχε εφαρμοστεί κατά την προηγούμενη 3ετία και πέτυχαν την επιστροφή στο παλαιότερο σύστημα, με τη διεξαγωγή, αρχικά, των τοπικών πρωταθλημάτων και στη συνέχεια, μίας τελικής φάσης για τη διεκδίκηση του Πανελλήνιου τίτλου. Η απόφαση για την (ουσιαστική) κατάργηση της Εθνικής κατηγορίας πάρθηκε από τη Γ.Σ. της ΕΠΟ[2] η οποία διεξήχθη το Σ/Κ 23-24 Σεπτεμβρίου 1933. Έτσι επωφελήθηκε και ο ΠΑΟΚ, που επανήλθε στο πανελλήνιο πρωτάθλημα 1933-34, χωρίς να δίνει αγώνες στο τοπικό για όλη τη σεζόν 1932-33 λόγω των αποφάσεων της ΕΠΟ, παραμένοντας στην Α' ΕΠΣΜ λόγω υποβιβασμού.