ARID4A

ARID4A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LCC, 2MAM, 2YRV
Ідентифікатори
Символи	ARID4A, RBBP-1, RBBP1, RBP-1, RBP1, AT-rich interaction domain 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 180201 MGI: 2444354 HomoloGene: 11303 GeneCards: ARID4A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • histone deacetylase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription repressor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • histone H3-K9 trimethylation • establishment of Sertoli cell barrier • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of gene expression by genetic imprinting • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • erythrocyte development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • histone H4-K20 trimethylation • histone H3-K4 trimethylation • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5926	238247
Ensembl	ENSG00000032219	ENSMUSG00000048118
UniProt	P29374	F8VPQ2
RefSeq (мРНК)	NM_002892 NM_023000 NM_023001	NM_001081195
RefSeq (білок)	NP_002883 NP_075376 NP_075377	NP_001074664
Локус (UCSC)	Хр. 14: 58.3 – 58.37 Mb	Хр. 12: 71.02 – 71.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARID4A (англ. AT-rich interaction domain 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 257 амінокислот, а молекулярна маса — 142 752.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKAADEPAYL		TVGTDVSAKY		RGAFCEAKIK		TVKRLVKVKV		LLKQDNTTQL
VQDDQVKGPL		RVGAIVETRT		SDGSFQEAII		SKLTDASWYT		VVFDDGDERT
LRRTSLCLKG		ERHFAESETL		DQLPLTNPEH		FGTPVIAKKT		NRGRRSSLPV
TEDEKEEESS		EEEDEDKRRL		NDELLGKVVS		VVSATERTEW		YPALVISPSC
NDDITVKKDQ		CLVRSFIDSK		FYSIARKDIK		EVDILNLPES		ELSTKPGLQK
ASIFLKTRVV		PDNWKMDISE		ILESSSSDDE		DGPAEENDEE		KEKEAKKTEE
EVPEEELDPE		ERDNFLQQLY		KFMEDRGTPI		NKPPVLGYKD		LNLFKLFRLV
YHQGGCDNID		SGAVWKQIYM		DLGIPILNSA		ASYNVKTAYR		KYLYGFEEYC
RSANIQFRTV		HHHEPKVKEE		KKDLEESMEE		ALKLDQEMPL		TEVKSEPEEN
IDSNSESERE		EIELKSPRGR		RRIARDVNSI		KKEIEEEKTE		DKLKDNDTEN
KDVDDDYETA		EKKENELLLG		RKNTPKQKEK		KIKKQEDSDK		DSDEEEEKSQ
EREETESKCD		SEGEEDEEDM		EPCLTGTKVK		VKYGRGKTQK		IYEASIKSTE
IDDGEVLYLV		HYYGWNVRYD		EWVKADRIIW		PLDKGGPKKK		QKKKAKNKED
SEKDEKRDEE		RQKSKRGRPP		LKSTLSSNMP		YGLSKTANSE		GKSDSCSSDS
ETEDALEKNL		INEELSLKDE		LEKNENLNDD		KLDEENPKIS		AHILKENDRT
QMQPLETLKL		EVGENEQIVQ		IFGNKMEKTE		EVKKEAEKSP		KGKGRRSKTK
DLSLEIIKIS		SFGQNEAGSE		PHIEAHSLEL		SSLDNKNFSS		ATEDEIDQCV
KEKKLKRKIL		GQSSPEKKIR		IENGMEMTNT		VSQERTSDCI		GSEGMKNLNF
EQHFERENEG		MPSLIAESNQ		CIQQLTSERF		DSPAEETVNI		PLKEDEDAMP
LIGPETLVCH		EVDLDDLDEK		DKTSIEDVAV		ESSESNSLVS		IPPALPPVVQ
HNFSVASPLT		LSQDESRSVK		SESDITIEVD		SIAEESQEGL		CERESANGFE
TNVASGTCSI		IVQERESREK		GQKRPSDGNS		GLMAKKQKRT		PKRTSAAAKN
EKNGTGQSSD		SEDLPVLDNS		SKCTPVKHLN		VSKPQKLARS		PARISPHIKD
GEKDKHREKH		PNSSPRTYKW		SFQLNELDNM		NSTERISFLQ		EKLQEIRKYY
MSLKSEVATI		DRRRKRLKKK		DREVSHAGAS		MSSASSDTGM		SPSSSSPPQN
VLAVECR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
• Otterson G.A., Kratzke R.A., Lin A.Y., Johnston P.G., Kaye F.J. (1993). Alternative splicing of the RBP1 gene clusters in an internal exon that encodes potential phosphorylation sites. Oncogene. 8: 949—957. PMID 8455946

Див. також

• Хромосома 14