HOXD9

HOXD9
Ідентифікатори
Символи	HOXD9, HOX4, HOX4C, Hox-4.3, Hox-5.2, homeobox D9
Зовнішні ІД	OMIM: 142982 MGI: 96210 HomoloGene: 8409 GeneCards: HOXD9
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • forelimb morphogenesis • peripheral nervous system neuron development • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • adult locomotory behavior • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • single fertilization • embryonic skeletal system development • mammary gland development • multicellular organism development • регуляція експресії генів • skeletal muscle tissue development • embryonic forelimb morphogenesis • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3235	15438
Ensembl	ENSG00000128709	ENSMUSG00000043342
UniProt	P28356	P28357
RefSeq (мРНК)	NM_014213	NM_013555
RefSeq (білок)	NP_055028	NP_038583
Локус (UCSC)	Хр. 2: 176.12 – 176.12 Mb	Хр. 2: 74.53 – 74.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXD9 (англ. Homeobox D9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 36 495.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGGSAGRLK		MSSSGTLSNY		YVDSLIGHEG		DEVFAARFGP		PGPGAQGRPA
GVADGPAATA		AEFASCSFAP		RSAVFSASWS		AVPSQPPAAA		AMSGLYHPYV
PPPPLAASAS		EPGRYVRSWM		EPLPGFPGGA		GGGGGGGGGG		PGRGPSPGPS
GPANGRHYGI		KPETRAAPAP		ATAASTTSSS		STSLSSSSKR		TECSVARESQ
GSSGPEFSCN		SFLQEKAAAA		TGGTGPGAGI		GAATGTGGSS		EPSACSDHPI
PGCSLKEEEK		QHSQPQQQQL		DPNNPAANWI		HARSTRKKRC		PYTKYQTLEL
EKEFLFNMYL		TRDRRYEVAR		ILNLTERQVK		IWFQNRRMKM		KKMSKEKCPK
GD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2